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分包工程竣工结算审计是分包工程全过程跟踪审计的第三步，是对分包工程预算的终确定。分包工程预算的合理性和准确性，直接体现着分包工程的审计质量和审计成果严格复核结算工程量。对结算工程量要严格审查和准确计算，将工程量的计算及变更签证的确认作为审计重点，注意工程量的重复和多计，增强对虚假变更签证的辨别力。工程量的确定要依据施工图和业主或建设单位签发的公务通知单、设计部门的设计变更单。尤其对现场变更工程量的确认，严防只计增不计减，要把握住“在一般情况下，有增必有减”的原则，如果有增无减，就要查明原因。对野外偏僻的施工签证，要有现场各级人员的签认，否决“一言堂”签证。
工程预算审计以基建项目为标，包括资金来源、基建计划、前期工程、征用土地、勘察设计、施工实施的一切财务收支；工程预算审核以单位工种为标的，只对单位工程预算的合理负责。
审计与工程预算审核是两个截然不同的专业学科，审计以会计师、审计师为主；而工程预算审核以工程经济和工程技术人员为主。目前 正在实行注册造价工程师制度，今后的工程预算审核，将以造价工程师为主。
工程预算的作用：
1.工程预算是施工企业与建设单位结清工程费用的依据；
2.工程预算是施工企业考核工程成本，进行经济核算的依据；
3.工程预算是编制概算定额和概算指标的依据。
工程预算的进行一般分为6个步骤：
1、熟悉招标相关文件与图纸
2、查询材料报价
3、确定劳务价格
4、工程量计算
5、组好综合单价
造价偏差管理（1）偏差预测：对项目进行中可能出现的偏差因素进行预测与分析。（2）检查与计算：对项目一定进度条件下的造价进行计算与检查，得出检查当时条件下的造价。（3）对比：对项目已完工程的预算造价与实际造价进行对比，发现造价偏差，计算出偏差值。（4）分析：对比较的结果进行分析，确定偏差幅度并找出偏差产生的原因。（5）纠偏：根据项目的具体情况和偏差分析结果，建议或采取适当的措施，使造价偏差控制在允许的范围以内或进行项目总造价目标的调整。
工程预算由于间接费、利润、税金等各项费用，是按照工程的专业（土建、安装、装饰、市政、人防、园林等）和工程类别（即按照施工难易程度分一、二、三、四类）分别规定了取费标准，审查时应该注意以下几个问题：审查取费标准是否与所用定额相匹配。在编制决算时，主体工程选用某专业定额，则取费标准必须选用与该专业配套使用的标准审查取费标准是否与工程类别相吻合。首先，根据工程规模及工程类别划分标准表，确定工程类别；然后，审查是否按确定的工程类别计取费用。如土建工程与安装工程的工程类别应分别按各自的工程类别划分标准表确定。
